東海大学付属福岡高校を語る上で欠かせないのが、全国トップクラスの実績を誇る運動部の存在です。広大な校地には専用の人工芝サッカー場や大型体育館が完備され、プロアスリートや指導者を多数輩出してきた育成環境が整っています。
旧校名「東海大五」時代から全国にその名を轟かせる男子サッカー部は、全国高校サッカー選手権大会やインターハイに多数出場する名門です。福岡県内屈指の激戦区で東福岡高校や飯塚高校と鎬を削り、Jリーグ下部組織出身者や全国の有望メンバーが切磋琢磨しています。また、近年目覚ましい躍進を遂げている女子サッカー部も全日本高等学校女子サッカー選手権で上位進出を果たすなど、男女ともに全国基準の強化が進んでいます。
さらに、近年全国的な注目を集めているのが女子バスケットボール部です。全国高校総体（インターハイ）やウインターカップの常連校となり、全国ベスト4や全国制覇を射程に捉える屈指の強豪へと成長しました。高い戦術眼とスピード、規律あるチームディフェンスは高校バスケ界で高く評価されており、全国各地からトップ選手が集結しています。
