企画展の華やかさに目を奪われがちですが、本館の真の真価は建築空間そのものと、約5,800点を超える国内屈指のアーカイヴを誇る常設展（MOTコレクション）にあります。
建築家・柳澤孝彦（TAK建築研究所）が手掛けた建築設計は、木場公園の豊かな自然と都市構造の結節点として機能するよう緻密に計算されています。南北に貫通する全長約140メートルの「プロムナード（光の回廊）」は、打ち放しコンクリートと鉄骨、スリガラスが織りなす直線的な美意識が極まり、歩行者の視線を自然光の陰影へと誘います。幾何学的なブリッジや、地下へと続くダイナミックな吹き抜け構造は、建築ファンにとっても第一級の観察対象です。
そして、一般観覧料わずか500円前後（企画展チケット所持者は割引または同伴観覧可能な場合あり）で入場できる常設展こそ、混雑を逃れて深く思考に沈むための特等席です。戦後日本のアヴァンギャルド、具体美術協会、もの派の重要作から、デイヴィッド・ホックニーやロイ・リキテンスタインといった海外の巨匠作品まで、キュレーターによる鋭いテーマ性に基づき定期的に展示替えが行われています。企画展の喧騒から離れ、静寂の中で名作と対話する時間は、感性を研ぎ澄ます贅沢なひとときを提供してくれます。
