埼玉県東部と千葉・東京多摩エリアを結ぶ要所であるため、どちらかの路線で遅延や運転見合わせが発生した際のリスク管理も把握しておきたいポイントです。
JR武蔵野線は風や天候、長距離路線特有の接続影響でダイヤが乱れやすい傾向があります。もし南越谷駅で武蔵野線がストップした場合、都心（北千住・上野・大手町方面）へ向かうのであれば、新越谷駅から東武スカイツリーライン（東京メトロ日比谷線・半蔵門線直通）を利用して都内経由で迂回するのが鉄則です。
逆に東武線が止まった場合は、武蔵野線で南浦和駅（京浜東北線乗換）や北朝霞駅（東武東上線・朝霞台駅乗換）、新松戸駅（常磐線乗換）へ抜けるバイパスルートが極めて有効に機能します。
