大手進学塾（馬渕教室・KECゼミナールなど）や五ツ木模試の最新データによると、畝傍高校普通科の偏差値は69〜71のレンジで極めて安定した推移を見せています。奈良県内の公立高校としては、最難関の奈良高校に次ぎ、郡山高校と並ぶトップ進学校のツートップの一角として不動の地位を築いています。
近年の奈良県公立高校入試における倍率推移を見ると、畝傍高校の一般選抜倍率は例年1.10倍〜1.25倍の間で推移しています。激しい倍率の乱高下が少ない背景には、中学校側の綿密な進路指導と、「内申点・学力ともに突き抜けた上位層しか出願できない」という高い参入障壁が存在するためです。
畝傍高校の難易度と人気の理由は、単なる学力偏重にとどまりません。近鉄大和八木駅および畝傍御陵前駅から徒歩圏内という抜群のアクセスに加え、吉野・高田・橿原・桜井など中南和全域から「地域で最も優秀な生徒」が集まる求心力を持っています。公立トップ校でありながら、私立難関校（西大和学園や帝塚山など）の併願先・併願戻りとしても極めて高い支持を集めています。
