「除菌中に食べてはいけないものは何か」という問いに対し、Aiプラスクリニックたまプラーザなどの消化器内科医は「医学的に絶対に摂取してはならない日常食品はごく一部に限られる」と解説しています。しかし、これは「何を食べても治療成績が変わらない」という意味ではありません。除菌治療のメカニズムを紐解くと、なぜ特定の飲食物を厳重に控えるべきなのか、その明白な理由が見えてきます。
ピロリ菌除菌の成否は、胃内のpHをいかに中性（pH5.5〜6以上）近くまで引き上げ、その状態を維持できるかにかかっています。治療で併用される抗菌薬（アモキシシリンやクラリスロマイシン）は、胃酸が充満する強酸性環境下では構造が不安定化し、十分な殺菌能力を発揮できません。そのため、胃酸分泌を強力に抑制するプロトンポンプ阻害薬（PPI）やカリウムイオン競合型アシッドブロッカー（P-CAB：ボノプラザン）が同時に処方されます。
ここで問題となるのが、胃酸分泌を強力に促してしまう食材や、薬剤の代謝を阻害する成分の存在です。せっかく薬剤で胃酸を抑え込んでいるにもかかわらず、食事によって胃酸分泌シグナルを強烈に刺激してしまえば、胃内が再び酸性に傾き、抗菌薬の効力は激減します。つまり、「食べてはいけないもの」の本質は、薬理作用を阻害する食品と、消化管粘膜への物理的・化学的刺激を増幅させて服用中断を誘発する食品に分類されます。
