セブン銀行ATMで最も気になるのが入金手数料の発生条件です。まずセブン銀行の口座宛てであれば、曜日や時間帯を問わず24時間365日いつでも入金手数料無料で利用できます。一方、他の金融機関のキャッシュカードを利用する場合は、各行が定める独自のルールが適用されるため注意が必要です。
ネット銀行勢では、入金額や取引回数に応じた無料特典が充実しています。例えばPayPay銀行セブンATM入金は、毎月最初の1回が無条件で無料、2回目以降も「1回あたり3万円以上」の入金であれば何度でも手数料がかかりません。同様に楽天銀行セブンATM入金も、1回3万円以上の預け入れであれば入金手数料は完全に無料となります。3万円未満の取引であっても、会員ステージプログラム（ハッピープログラム）の無料回数が残っていればコストはかかりません。
メガバンクやゆうちょ銀行を利用する場合は、平日昼間以外の時間帯や優遇ステージの有無が分岐点となります。
三井住友銀行セブンATM入金は、SMBCポイントパックやOliveアカウントの契約状況によって所定回数までコンビニATM手数料が無料化されます。三菱UFJ銀行セブンATM入金も「スーパー普通預金（メインバンク プラス）」の優遇条件を満たすことで手数料の優遇を受けられます。対してみずほ銀行セブンATM入金手数料は、「みずほマイレージクラブ」のステージ特典がなければ時間帯に応じた手数料が発生するため事前の確認が欠かせません。また、ゆうちょ銀行セブンATM入金は曜日や時間帯によって手数料（110円〜330円程度）が加算される仕組みとなっているため、無計画な少額入金は避けるのが賢明です。
