キャッシュレス決済が完全に定着した現在、モスバーガーモバイルオーダーの支払い方法は極めて柔軟に設計されています。クレジットカード（VISA、Mastercard、JCB、American Express、Diners）はもちろんのこと、QRコード決済において圧倒的な利用者を誇るPayPayへの対応も完全に標準化されました。その他、d払い、楽天ペイ、au PAYなどの主要コード決済もシームレスに利用できます。
ただし、ここで初心者が陥りがちな「2つの落とし穴」が存在します。
第1の落とし穴は、「店頭で使える決済手段がすべてモバイルオーダーで使えるわけではない」という点です。現金払いや交通系ICカード（Suica、PASMO等）、商業施設共通のポイント支払いはモバイルオーダーの事前決済では選択できません。完全にオンライン上で決済を完結させることがシステム上の大前提となっています。
第2の落とし穴は、「クーポンの適用範囲」です。折込チラシや店頭で配布された紙の割引クーポンは、モバイルオーダー画面の注文では適用できません。利用できるのは、公式アプリ上で配信されている「モバイルオーダー専用クーポン」に限定されます。知らずにレジ前で紙クーポンを提示しても「モバイルオーダー注文分の割引処理はできない」と断られるため事前の確認が欠かせません。
では、最もお得に購入するための「裏ワザ」はどこにあるのか。それは公式プリペイドカードであるモスカードのオンライン決済チャージを活用したポイントの多重取りです。
モスバーガーでは毎月25日・26日を「モスカードの日」と定めており、この日にWeb上でクレジットカードからモスカードへチャージ（1,000円以上）を行うと、通常チャージを大幅に超える4%相当のMOSポイントが付与されます。これにお手持ちの高還元クレジットカード（1.0%還元など）の決済ポイントを組み合わせれば、実質還元率は5%前後に跳ね上がります。さらにアプリ内のモスバーガーモバイルオーダー限定クーポンを併用すれば、1食あたり数十円から百数十円単位の確実な節約が成立します。
