東京駅を普段利用しない方にとって最大の難関となるのが、店舗の正確なロケーションです。「東京駅 富士見堂 場所 改札内」と検索されることが多い通り、富士見堂グランスタ東京店はJR改札内・地下1階の「グランスタ東京（スクエア ゼロ〜銀の鈴エリア周辺）」に位置しています。
八重洲地下中央口改札から入場した場合、有名な待ち合わせスポットである「銀の鈴」を目指して直進するとスムーズにアクセスできます。丸の内側から入場した場合は、地下連絡通路を経由して八重洲側のグランスタ中央通路方面へ進むルートが最短です。改札外の店舗ではないため、新幹線や在来線の乗り換え合間に立ち寄れる利便性がある一方、駅の外から訪れる場合は入場券が必要となります。
また、混雑対策として導入される「富士見堂 あんこ天米 整理券」の運用については、時期や混雑密度によって柔軟に変更されています。繁忙期の朝一番など、待機列が他店舗の通行を妨げる恐れがある場合には、時間帯指定の購入整理券が配布されるオペレーションが敷かれます。整理券を受け取った場合でも指定時間内の再来店が必要となるため、新幹線の発車時刻には余裕を持ったスケジュールを組む必要があります。
