私立大学工学部の4年間総学費は、通常であれば約550万〜650万円程度に達します。それに対し、豊田工業大学の初年度納入金は約80万円、4年間の総学費は約280万円と、国立大学標準額(4年間約242万円)に極めて近い水準に抑えられています。
破格の学費設定を可能にしているのは、トヨタ自動車が拠出した巨額の基金による運用益と継続的なバックアップです。大学経営を学生の授業料のみに依存しない強固な財務体質が構築されているため、質の高い研究設備と低廉な学費の両立が成り立っています。
経済的支援の面でも独自の奨学金制度が整備されており、学業成績優秀者に対する授業料減免制度や生活支援制度が機能しています。地方からの進学者が多いことも考慮され、生活コストを大幅に抑えられる学生寮も整備されており、経済的な理由で理系進学をためらう優秀な層にとって理想的な学習環境が提供されています。