はや山荘を利用する際の宿泊プランと料金設定は、利用スタイルに合わせて選択可能です。一般的な山岳宿泊施設の基準に沿った明確な料金体系が敷かれています。
基本となる1泊2食付きプランは概ね9,000円〜12,000円台で設定されていることが多く、夕食と朝食の双方が提供されます。早朝出発を希望する登山者向けには、朝食をお弁当に切り替えるサービスや、自炊派向けの「素泊まりプラン（6,000円〜7,500円前後）」が用意されている場合もあります。
また、宿泊を伴わないハイカー向けに、昼間の休憩利用やトイレチップ（維持協力金として100円〜200円程度）を設定している施設情報も見受けられます。山小屋の維持管理にはヘリコプター等での物資荷揚げ費用が含まれているため、支払いは現金を基本として小銭を多めに用意していくのが賢明です。
