本作の中盤以降、読者を最も戦慄させたのが主要メンバーたちの壮絶な負傷・死亡描写です。少年漫画の枠を超えたシビアな現場感で描かれた名シーンの数々は、作品の緊張感を極限まで高めました。
宝島編で読者に大きなショックを与えたのが銀狼の重傷シーンです。敵の潜入捜査中、イバラの配下によって腹部を槍で深く貫かれた銀狼は、大量出血で意識を失い死の淵に立たされました。相棒の金狼すら絶叫する絶体絶命の中、千空たちはあえて島全体を包む石化光線に銀狼を巻き込ませる決断を下します。結果として石化が止血と細胞修復の役割を果たし、銀狼は命を繋ぎ止めることに成功しました。
さらに激しさを極めたのが、南米アラハバキで行われたスタンリー・スナイダー率いる軍事部隊との最終決戦です。ここでは、科学王国側の防衛戦力として立ちはだかった氷月がスタンリーの銃撃を受け、致命傷を負って心肺停止に追い込まれました。コハクや司も次々と凶弾に倒れ、千空自身も狙撃されるという全滅寸前の状況下、千空が下した起死回生の策が「全世界へのメデューサ再起動」でした。
全地球を再び石化させることで、敵であるスタンリー部隊もろとも全員を一旦石に変え、長い年月をかけて一人残されたスイカが復活液を作り出して仲間たちを一人ずつ蘇生。氷月もこのプロセスを経て完璧に復活を遂げました。
