SNSや口コミサイトにおける膨大な実訪問者のレビューを精査すると、来館者が直面する「現実的なギャップ」が浮かび上がってきます。
最も多く見られる称賛の声は、「800円の入館料でここまでのスケールを見せられるとは思わなかった」「水族館だけでなく、巨大なマンモスの化石や昔の民家の実物展示まであり、大人でも足が棒になる」というコストパフォーマンスと知的充足度の高さです。小中学生が無料という太っ腹な設定も手伝い、ファミリー層からの熱烈な支持が集まっています。
一方で、ネガティブな意見として散見されるのが「広すぎて半日では回りきれない」「子供が歩き疲れてぐずってしまった」という、想像以上の広大さに起因する疲労感です。館内の歩行距離は優に数キロメートルに及ぶため、観光ルートを組む際は所要時間を最低でも3時間、食事を含めるなら半日（4〜5時間）と想定しておく必要があります。
また、滋賀県立琵琶湖博物館は雨の日の見どころとしても関西エリア随一の実力を持っています。エントランスから展示室A・B・C、水族展示室、ディスカバリールームに至る主要動線がすべて屋内連結されており、天候が崩れた休日でも濡れることなく快適に滞在できます。雨天時は屋外の観光地から観光客が一気に流入するため、午前10時前後の早い時間帯に入館するのが混雑を回避する鉄則です。
