順風満帆に見えた政治家人生に大きな暗雲が垂れ込めたのが、自民党派閥（清和政策研究会／安倍派）を巡る政治資金問題でした。大塚拓氏はパーティー券収入の不記載が発覚し、党規約に基づく「戒告」処分を受けることになります。
そして迎えた2026年10月の第50回衆議院議員総選挙。長年守り続けてきた埼玉9区（飯能市、狭山市、入間市、日高市、毛呂山町、越生町）から出馬したものの、逆風は凄まじいものでした。党の処分方針により比例代表との重複立候補が認められず、背水の陣で挑んだ選挙戦でしたが、立憲民主党の候補に敗れて無念の落選を喫しました。
同じ選挙において、妻の丸川珠代氏も参議院から衆議院（東京7区）へ鞍替え出馬したものの落選し、「夫婦ダブル落選」という衝撃的な結果となりました。地元・埼玉9区における大塚氏の評判は、「政策通で実力があるだけに資金問題が本当に惜しまれた」「落選後も腰を低くして駅頭に立つ姿に熱心さを感じる」といった声がある一方、政治不信の根深さから依然として厳しい視線を向ける有権者も少なくありません。
