祖父江中学校の放課後を彩る部活動は、運動部・文化部ともに熱心な指導が行われてきました。野球、サッカー、ソフトテニス、バスケットボール、バレーボール、卓球、陸上といった定番の運動部に加え、吹奏楽部や美術部、パソコン部などの文化活動も活気を見せています。
特筆すべきは、部活動指導員や外部指導者の活用が進んでいる点です。教員の負担軽減と専門的指導の高度化を両立するため、休日の地域クラブ活動への段階的移行が進められており、生徒が無理のないペースで競技力を伸ばせる体制づくりが進んでいます。
また、年間行事においては秋の体育祭や文化祭（合唱コンクール）が生徒主導で熱狂的に行われます。特に合唱コンクールでは、クラスごとの団結力が試される伝統行事として高い集中力と完成度を誇り、生徒の自己肯定感や協調性を育む貴重な場となっています。
