雨天時や猛暑日には、新宿駅東口から直結している地下街「新宿サブナード（Subnade）」を経由するルートが最適です。地上を歩く時間を数十秒程度に抑えられます。
【雨天時のおすすめ地下ルート】
① JR新宿駅東口、または東京メトロ丸ノ内線新宿駅の改札から「新宿サブナード」の地下連絡口へ進みます。
② サブナードのメイン通路を西武新宿駅・歌舞伎町方面（北西方向）へ歩きます。
③ 「サブナード8番出入口」または「10番出入口」の階段から地上へ上がります。
④ 地上に出るとすでに歌舞伎町シネシティ広場の至近距離に位置しているため、小走りで数十メートル進むだけで雨に濡れずに東京ミステリーサーカスへ入館できます。
