ペルビアンジャイアントオオムカデが世界的な知名度を獲得した最大の要因は、その規格外の捕食行動にあります。通常のムカデ類は地表を徘徊し、昆虫やクモ、小型の爬虫類などを主食としますが、本種は飛翔中の哺乳類であるコウモリ（小型コウモリ類）を空中で捕食するという極めて特異なハンティング技術を確立しています。
生物学の調査映像や現地観測データによると、彼らは洞窟の険しい岩壁をよじ登り、後方の数対の脚で天井の突起を強固にホールドします。そして上半身を完全に宙吊りにした状態で待ち伏せを行い、暗闇の中を飛び交うコウモリが射程圏内を通過した瞬間、前肢と鋭利な顎肢（毒牙）を電石火火のスピードで突き出して空中で捕獲します。
捕獲後は獲物の首元や胸部に即座に毒を注入し、暴れるコウモリの動きを麻痺させた上で、数時間をかけて骨や皮以外の肉を完食します。このアクロバティックかつ計算された狩猟行動は、本種が単なる節足動物の枠組みを超えた高度な筋力と空間把握能力を備えている動かぬ証拠です。
