「なぜ、あるはずの砂浜が海中に消えてしまうのか」——この素朴な疑問の背景には、与論島特有のサンゴ礁地形と天体運動が生み出す潮汐メカニズムが存在します。百合が浜は、与論島最大のビーチである大金久海岸の沖合約1.5kmに位置する浅瀬（砂堆）に形成されます。島の周囲を取り囲む裾礁（リーフ）の内側にサンゴや貝殻の破片、有孔虫の遺骸が海流によって運ばれ、長年かけて海底の特定ポイントに堆積した構造を持っています。
この砂堆の標高は周囲の海底よりもわずかに高く形成されているものの、満潮時の海面よりは低い位置にあります。そのため、月と太陽の引力が重なる大潮や中潮の干潮時間になると海水面が大きく下がり、海面上に白い砂浜として姿を現します。逆に、潮が満ち始めると数時間のうちに完全に水没し、何事もなかったかのように元の青い海へと戻っていきます。この干満差のダイナミズムこそが、百合が浜の幻の砂浜と呼ばれる真相です。
さらに興味深いのは、現れる砂浜の形状、面積、そして出現位置が日によって微妙に変化する点です。潮流の強さや直近の波浪条件によって砂が移動するため、訪れるたびに異なる表情を見せる「一期一会の絶景」が生み出されます。
