科学技術館の混雑度を大きく左右する外部要因が「天候」と「学校カレンダー」です。とりわけ雨の日の混雑状況は、晴天の休日と比較して一段と過酷さを増します。千代田区周辺の屋外施設（上野公園や日比谷公園など）を行き先としていたファミリー層が一斉に北の丸公園へと進路変更するため、開館直後からフロア全体が過密状態に包まれます。
雨の日の最大のリスクは「屋外逃げ場」の消失です。晴天時であれば北の丸公園の芝生広場で走り回ったり、ベンチで持参した弁当を広げたりできますが、雨天時は全員が館内に留まり続けます。結果として、2階から5階の通路や休憩用ベンチは終日埋まり、館内の体感温度や騒音レベルが著しく上昇します。
一方、季節ごとの波動を見ると、春休み・夏休みの混雑は土日のみならず平日にまで波及します。特に夏休みの7月下旬から8月中旬にかけては、「夏休みの自由研究」のテーマ探しを目的とした小学校中高学年が殺到します。
また、平日に訪れる際に注意しなければならないのが、小中学校の「社会科見学・校外学習」による大型観光バスの受け入れです。5月〜6月および10月〜11月の平日は、午前10時から13時にかけて数十校に及ぶ団体児童が一斉に館内を回遊します。個人来館者が「平日だから空いているはず」と油断して訪れると、黄色い帽子をかぶった児童の列に巻き込まれ、目当ての装置に一切触れられないという逆転現象が起こります。
