快適な参拝を果たすためには、事前の交通計画が不可欠です。日枝大神社へのアクセスは、最寄り駅から徒歩または路線バスを利用するのが基本となります。主要駅からの路線バスは本数も安定しており、下車後数分で社頭に到着できるため公共交通機関の利用が推奨されます。
車で訪れる参拝者が気になる駐車場事情ですが、境内または隣接地に参拝者用スペースが用意されている場合が多いものの、収容台数には限りがあります。特に週末や大安吉日、年中行事の際には満車になりやすいため、周辺のコインパーキングの位置をあらかじめ把握しておくと安心です。
また、初詣の混雑状況には細心の注意を払う必要があります。大晦日の深夜から元日の日中にかけては、厄除けや新年の家内安全を願う参拝者で行列ができます。混雑を巧みに回避したい場合は、早朝（午前7時〜8時台）または夕方（16時以降）の時間帯を狙うか、松の内（1月4日〜7日頃）に日をずらして参拝するのが賢明な選択です。通常の参拝時間は終日開放されている場合が多いですが、授与所での授与品対応は夕刻で終了するため注意してください。
