中本を日常的に利用する常連客の間では、卓上の調味料やトッピング、麺の調整を組み合わせた裏カスタマイズが確立されています。券売機で食券を購入した後、店員に渡すタイミングで行うコールによって、自分だけの一杯へと最適化することが可能です。
代表的なカスタマイズの選択肢には以下のものがあります：
- 麺の硬さ・量：「麺硬め」「麺柔らかめ」のほか、「麺少なめ（3/4量）」「麺半分」が指定可能。麺半分を指定すると、店舗によってはサービスで生卵やゆで卵、小ウーロン茶などの代替品が付与される場合もあります。
- 油の量：「油少なめ」を指定することで、スープ表面のラード層が薄くなり、ダイレクトに出汁と唐辛子の輪郭を感じることができます（胃もたれ防止にも有効）。
- 辛さアップ（北極・冷し味噌系限定）：「辛さ2倍〜10倍」まで無料で増量が可能です。唐辛子パウダーが大量に投入されるため、スープがペースト状に変化します。
また、辛さを自在にコントロールし、味わいを格上げする蒙古タンメン中本のおすすめトッピングには確固たる定番が存在します。
激辛メニューをマイルドに楽しみたい場合、「背脂（60〜100円前後）」や「スライスチーズ（70円前後）」、そして「生卵」の追加が鉄板です。脂分と乳製品のタンパク質がカプサイシンを包み込み、辛味の刺激を劇的に和らげながら、カルボナーラのような濃厚なコクをプラスしてくれます。逆に食感のアクセントと清涼感を求める層には、「ネギ」や「ほうれん草」、「スラ玉（輪切りスライスゆで卵）」が絶大な支持を集めています。
そして、常連客が必ず併用しているのが「蒙古タンメン中本公式アプリ」です。アプリをダウンロードして会員登録を行うだけで、来店ごとに利用できる電子クーポンが配信されます。「ウーロン茶サービス」「プチ麻婆丼サービス」「生卵またはプチライス」など、本来なら100円〜150円前後するトッピング類が毎回無料で付与されるため、使わない手はありません。さらに、来店ポイントを貯めることでオリジナルの限定グッズ（Tシャツやパーカー、特製食器）と交換できる仕組みがファンのリピート動機を強固に支えています。
