天然由来成分である重曹とクエン酸は安全性の高さが魅力ですが、使い方を誤るとトラブルにつながる重曹クエン酸危険性も潜んでいます。
第一に注意すべきは、塩素系漂白剤（カビ取り剤やパイプクリーナー）との混触です。クエン酸などの酸性物質が塩素系洗剤と混ざると、人体に極めて有害な有毒塩素ガスが発生します。絶対に同じタイミングで使用してはなりません。
第二に、密閉容器内での混合です。スプレーボトルやペットボトルの中に重曹、クエン酸、水を同時に入れてフタを閉めると、発生した二酸化炭素の圧力によって容器が破裂・破損する事故を引き起こします。作り置きの混合液は絶対に密閉保存しないでください。
なお、純度の高い食品添加物規格の粉末を使用すれば、自家製の炭酸水作り方重曹クエン酸として飲料に用いることも可能です（水200mlに各小さじ半分程度）。ただし、掃除用の工業用グレードには不純物が含まれる場合があるため、口に入れる用途には必ず「食品用」と明記された製品を選ぶ必要があります。
