なごやか亭の店舗ネットワークは、発祥の地である釧路エリア、観光客と地元民が集う札幌・帯広エリア、そして本州で唯一展開されている関西エリア（滋賀・京都）に大別されます。
1. 釧路エリア：原点の息吹を感じる「釧路本店・春採店・昭和店」
ブランドの発祥地である釧路には、「釧路本店」をはじめ複数の店舗が点在します。地元漁港との結びつきが最も強く、朝獲れの地魚が最速でレーンに届くため、道内屈指の鮮度を誇ります。地元民の日常食として深く定着しているエリアです。
2. 札幌エリア：激戦区で輝く人気店群
「発寒店」「白石本通店」「福住店」「屯田店」など、札幌市内の幹線道路沿いや住宅街に展開。道外からの観光客がレンタカーやタクシーで訪れるケースも多く、週末のディナータイムは常に満席となります。広い駐車場を備えた大型ロードサイド店舗が多いのが特徴です。
3. 関西エリア：滋賀（草津・守山・大津）＆京都（綾部・桂）
なごやか亭が関西に出店している事実は、道外の寿司ファンにとって驚きを与えます。「草津木川店」「守山店」「大津大将軍店」といった滋賀店舗や「京都桂店」など、関西の店舗でも北海道から航空便・チルド輸送を駆使して毎日のネタを調達。関西にいながらにして北海道本店の味と活気をそのまま体験できるとあって、遠方からも寿司好きが詰めかけています。
