本館にあたるいわき市の「アクアマリンふくしま」が太平洋の潮目をテーマにした大型海洋科学館であるのに対し、猪苗代のカワセミ水族館は福島県内の淡水環境に特化した地域密着型のエコ水族館という明確な住み分けがなされています。
前身である「旧いなわしろ淡水魚館」は1989年に開館し、長年親しまれてきたものの、施設の老朽化や東日本大震災の影響などを受けて運営の岐路に立たされていました。転機となったのは2015年のリニューアルです。公益財団法人ふくしま海洋科学館が指定管理者となり、展示コンセプトを刷新。「森と川と水辺の生き物」をテーマに掲げ、建物のデザインから水槽レイアウトまで大幅な改修が行われ、現在の洗練された展示空間へと生まれ変わりました。
大規模な海洋水族館では見落とされがちな「身近な水辺の生態系」に光を当てたことで、小規模ながらも知的好奇心を刺激する独自のポジションを確立しています。
