羽田空港の国際線を利用する旅行者の間で、現在最も頻発している重大なトラブルが「ターミナルの取り違え」です。SNS上でも「羽田の国際線は全部第3ターミナルだと思い込んでいたら、乗る便が第2ターミナル出発で搭乗締切ギリギリに走った」という投稿が後を絶ちません。
この混乱の背景には、第2ターミナル国際線違い理由という構造的な変遷があります。羽田空港の国際線枠拡大に伴い、全日本空輸（ANA）の一部国際線運航便が第2ターミナル南側の国際線施設へ移管されました。すなわち、「国際線＝第3ターミナル」という常識はすでに過去のものとなっており、ANA利用者は事前に第2ターミナル発着か第3ターミナル発着かを航空券控えで確認することが絶対条件となっています（※JALや外資系航空会社の多くは引き続き第3ターミナルを中心に運航）。
もしターミナルを間違えて到着してしまった場合、救命ボートとなるのが無料ターミナル連絡バス乗り場です。第3ターミナルの1階バス乗り場（9番のりば）から発着する無料シャトルバスは、約4分〜8分間隔で第1・第2ターミナル間を周回しています。所要時間は約7分〜10分程度ですが、深夜帯（0時台〜早朝4時台）は運行本数が減便されるか運行が停止するため、その際は京急線やモノレールの始発を待つか、歩道がない湾岸高速エリアゆえタクシー移動を強いられる点に厳重な警戒が必要です。
また、大きな荷物を抱えた旅行者が迷いやすいのが手荷物一時預かり所場所です。第3ターミナルでは「2階 到着ロビー」と「3階 出発ロビー」の双方に設置されています。2階は手荷物宅配カウンターと併設されており、手ぶらで都内観光へ向かうインバウンド客や深夜のチェックイン待ち旅行者が重宝しています。ロッカーに入らない大型スーツケースやスノーボードバッグなども対応可能ですが、営業時間や引き取り時間には所定の規定があるため、預け入れ時の伝票確認を怠ってはなりません。
