進学や転居で最も確認が欠かせないのが「学区（通学区域）」の境界線です。村岡中学校の通学区域は、主に藤沢市立村岡小学校の卒業生がそのまま進学する形を軸とし、周辺の大道小学校や高谷小学校の特定区域からも合流する編成となっています。
対象住所としては、弥勒寺（1〜4丁目）、村岡東（1〜4丁目）、小塚の一部、渡内、高谷の一部などが含まれます。このエリアは武田薬品工業の湘南アイパーク（湘南ヘルスイノベーションパーク）や先端研究施設を抱える学術・産業エリアに隣接しつつ、古くからの寺社や緑地が共存する良好な文教住宅街です。
特筆すべきは、母体校である藤沢市立村岡小学校との連携体制です。小中一貫教育の試みとして、小学校高学年と中学校教員の相互乗り入れ授業や部活動体験会が定期的に開かれており、いわゆる「中1ギャップ」の緩和に成果を上げています。小学校時代の友人関係が円滑に中学校へ引き継がれるため、新入生が疎外感を覚えにくいコミュニティ構造が強みです。
通学路の安全性に関しても、地域ボランティアやPTAによる見守り活動が定着しています。境川沿いや細い生活道路で一部車道幅が狭い箇所はあるものの、街灯のLED化や防犯カメラの設置が計画的に進められており、女子生徒の登下校に関しても保護者からの信頼は厚い水準を保っています。
