多くの寺社巡り愛好家や観光客が本行寺に惹きつけられる最大の理由は、「風流な景勝地の記憶」と「宗派史を揺るがす聖跡」という、異なる二つの圧倒的な歴史的重層性にあります。
荒川区西日暮里に位置する日暮里本行寺は、室町時代の文明元年（1469年）、江戸城を築いた太田道灌の孫にあたる太田資高公により江戸城内平川口に開創されたと伝えられています。その後、江戸城拡張に伴い神田、谷中を経て、宝永年間（1700年代初頭）に現在の西日暮里の高台（日暮里崖線）へと移転しました。
当時、この崖の上からは東に開けた筑波山や三河島、遠く房総半島まで一望でき、秋の澄んだ夜空に浮かぶ月を鑑賞する絶好の景勝地でした。風雅を愛する江戸の文人墨客が集い、夜を徹して月見の宴を催したことから、別名「月見寺（つきみてら）」と称され親しまれるようになった経緯があります。
一方、大田区池上に位置する「大坊本行寺」は、鎌倉時代の弘安5年（1282年）、日蓮宗の宗祖である日蓮聖人が病気療養のため常陸国へ向かう途上、池上宗仲公の館にて61歳の生涯を閉じた（ご入滅された）まさにその場所に建つ由緒正しき寺院です。日蓮聖人の息吹が今なお色濃く残る聖地として、全国から熱心な信徒や参拝者が途切れることなく訪れています。
