丸亀製麺における持ち帰り弁当の買い方は、大きく分けて「店頭注文」と「丸亀製麺持ち帰り予約（モバイルオーダー）」の2通りが存在します。一見するとネット注文のほうが圧倒的に有利に思えますが、実は利用シーンによって明確なメリットとデメリットが存在します。
まず、スマートフォンのブラウザや公式アプリから利用できるモバイルオーダーは、ランチピーク時の大行列を完全にスキップできるのが最大の強みです。受け取り時間と店舗を指定し、クレジットカードやキャッシュレス決済で事前に支払いを済ませておけば、店舗奥の専用受け取り口で店員に予約番号を提示するだけで商品を受け取れます。待ち時間はほぼゼロであり、時間効率（タイパ）を最優先するビジネスパーソンにとっては必須の選択肢です。
一方で、店頭注文には「自由度の高さ」という代えがたいメリットが残されています。丸亀製麺の魅力である無料の「青ねぎ」「天かす」「おろししょうが」のトッピングに関して、モバイルオーダーではあらかじめ決められた小袋や少量カップでの提供に限定される店舗が多数派です。自分の好みに合わせて薬味をたっぷり盛り付けたい場合や、揚げ場に並んでいる出来立ての「丸亀製麺持ち帰り天ぷら単品」を目で見て選びたい場合は、店頭注文で持ち帰り用レーンを進むほうが満足度は確実に高くなります。
