水藻フィッシングセンターを利用するにあたり、最も注意すべきは厳格に定められたレギュレーションです。魚体の保護と安全管理のため、ルール違反に対しては厳正な処置が取られます。
すべてのルアーにおいて完全バーブレスフック（カエシなし）の使用が義務付けられています。カエシ付きフックをペンチ等で完全に潰した状態でも認められるケースが多いものの、受付時の確認や抜き打ちチェックが行われることもあるため、事前のフック交換が推奨されます。トレブルフック（3本針）についても、場所や状況によりシングルフックへの変更が求められる場合があるため確認が必要です。
また、当然ながらキャッチ＆リリースが絶対原則です。釣り上げたバスを乾いたコンクリート上に直置きすることや、素手で長時間握りしめる行為は厳禁とされています。ランディングネットを使用し、速やかに水中でフックを外してリリースするマナーが求められます。
