事件直後から現代に至るまで、インターネットや週刊誌メディアを中心に「現場写真の真偽」に関する様々な議論が交わされてきました。特に、総監室の絨毯の上に並べられた三島と森田の首の写真は、世界中の通信社や海外メディアを通じて瞬く間に報じられました。
結論として、警察鑑識班や報道陣の一部によって撮影された現場写真は本物です。当時、突入した警視庁捜査一課と鑑識課が現場検証を行い、法廷証拠として正式に記録されました。小賀正義や古賀浩靖らは、自決直後に両名の首を総監室の床に並べ、乱れた髪や表情を整えて合掌したと供述しています。
遺体の搬出後、三島と森田の遺骨・遺体は慶応義塾大学病院の法医学教室にて司法解剖が行われました。法医学者らの手によって切断された首と胴体は丁寧に縫合され、死化粧を施された上で、翌日には遺族へと引き渡されました。三島の遺骸は自宅へ無言の帰宅を果たし、楯の会の制服を身にまとい、軍刀を抱いた姿で棺に納められたことが遺族や関係者の手記に詳しく記されています。
