東横INNの代名詞とも言える無料朝食ですが、同館では地域色を意識したラインナップが導入され、宿泊客の朝の満足度を底上げしています。
リニューアル以降の東横イン京都五条烏丸 朝食メニューでは、定番のおにぎりや焼きたてパン、お味噌汁、スクランブルエッグなどに加え、日替わりで提供される京都らしい「おばんざい」小鉢が好評です。健康志向の宿泊者向けにサラダバーやスープ類も充実しており、朝のエネルギーチャージには十分なクオリティが担保されています。混雑時向けに客室へ持ち帰って食事ができる専用容器が用意されている点も、プライベート空間でゆっくり過ごしたい読者から高い支持を集めています。
館内設備と客室仕様に関しては、東横イン京都五条烏丸 喫煙 禁煙フロアが厳格に分離されており、タバコの臭いに敏感な方でも禁煙ルームを安心して指定できます。SDGs推進の一環として導入されている東横イン京都五条烏丸 アメニティバーでは、歯ブラシやカミソリ、ナイトウェア（パジャマ）などをロビー階から必要な分だけピックアップするスタイルを採用。客室備え付けの個別エアコンや加湿空気清浄機、深めのバスタブなど、実用性を重視した設備構成が完備されています。
