警察による公式な捜査結末が曖昧さを残したため、ネット上やノンフィクション界隈では長年にわたり多種多様な説が議論され続けています。
特に有力視された別ルートとして、「元陸上自衛隊員・スナイパー犯行説」や「北朝鮮工作員関与説」があります。現場に残された足痕や目撃された逃走手口の鮮やかさから、オウムとは異なる軍事訓練を受けたプロによる犯行ではないかという見方です。また、裏社会とオウムの地下コネクションによる暗殺代行説など、真相を巡る考察は今なおネット掲示板やSNSで盛んに交わされています。
確固たる物証が提示されなかったことが、多くの陰謀論や憶測を生み続ける土壌となっており、「国家権力の頂点が狙われながら真相が闇に葬られた」という未解決特有の不気味さを際立たせています。