国公立大学最大の魅力のひとつが学費の負担軽減ですが、新見公立大学は公立大学法人として極めて良心的な費用設定となっています。入学料は新見市内在住者に対して大幅な割引が適用されるほか、年間授業料は文部科学省の標準額に準じた年額535,800円に設定されています。
経済的支援策として、国の「高等教育の修学支援新制度」の対象機関であることはもちろん、大学独自の授業料減免制度や特待生制度も運用されています。家計急変や経済的理由により修学が困難になった学生に対し、全額または半額の授業料免除措置が設けられており、学ぶ意欲を経済面で断ち切らないセーフティネットが敷かれています。
さらに、岡山県や新見市、各種医療法人による修学資金貸与制度（一定期間の勤務で返還免除となる看護師等修学資金など）を併用する学生も多く、私立の医療系・保育系大学に進学する場合と比較すると、4年間の総負担額を圧倒的に低く抑えることが可能です。
