同社をめぐり最も多くの憶測を呼んでいるのが「宗教ではないか」という疑惑です。事実関係を明確にしておくと、幼児活動研究会は特定の宗教法人や思想団体とは一切関係がありません。それにもかかわらず、なぜ「宗教」と比喩されてしまうのでしょうか。この背景には、組織社会学や心理学で説明される「高文脈な理念浸透メカニズム」が働いています。
同社は「教育を通じて社会に貢献する」「自立した強い人間を育てる」という創業以来の理念を徹底的に重んじています。新入社員研修では、徹底した発声練習、長距離の行進、自己鍛錬のワークなどを通じて、自らの甘えを捨て去る儀礼的プロセスが組まれます。心理学において、過酷なイニシエーション（通過儀礼）を共に乗り越えた集団は、強烈な「情動的コミットメント（情緒的一体感）」を獲得することが知られています。
この結果、現場の指導員は信じられないほどの熱量と笑顔、強い連帯感を持って子どもたちと向き合います。しかし、この内輪の一体感が外部から観察された瞬間、あまりの純粋さと熱気の異様さゆえに「洗脳されているのではないか」「新興宗教のようだ」というステレオタイプな誤解に変換されてしまうのです。
創業者である山下卓史氏が提唱してきた人間教育の厳格さは、園経営コンサルティング部門（日本経営教育研究所）を通じても全国の幼稚園・保育園に普及しています。園の先生方を集めたセミナーや指導現場の熱烈な空気感に圧倒された外部者が、その衝撃をネット上に「まるで宗教の集会」と書き込むことが、噂が再生産され続ける根本的なメカニズムといえます。
