滞在中の大きなハイライトとなるのが、中庭の景観を眺めながらいただく食事の数々です。宿泊者の間でとりわけ評価が高いホテル ザ 三井 京都の朝食口コミでは、「京都で一番美味しいホテルモーニング」と推す声が後を絶ちません。
イタリア料理「FORNI（フォルニ）」で提供される朝食は、和朝食・アメリカンブレックファスト・コンチネンタルのセットメニューに加え、焼きたての絶品クロワッサンやペストリーがサーブされます。特に和朝食は、京都の老舗米屋「八代目儀兵衛」の炊きたてご飯と上品な焼き魚、旬の小鉢が並ぶ贅沢な仕上がりで、朝から至福の時間を過ごせます。
宿泊者以外からも絶大な人気を誇るのが、ロビーラウンジ「THE GARDEN BAR」のホテル ザ 三井 京都のアフタヌーンティーです。京都の四季をモチーフにした芸術的なスイーツとセイボリーが有田焼や漆器の器に美しく盛り付けられ、予約困難なティータイムとして知られています。また、ホテル ザ 三井 京都のレストランランチでは、FORNIの薪窯ピッツァや、イノベーティブフレンチ「都季（TOKI）」の上質なコースが記念日利用を中心に高く支持されています。
