物語の根幹を成す化学物質「APTX4869(アポトキシン4869)」は、単なる暗殺用毒薬ではない。主人公の体に起きた幼児化現象は、組織が追い求める極秘研究の「副作用」に過ぎないという説が極めて濃厚だ。「時の流れに逆らって、死者を蘇らせようとしている」という灰原哀の過去の発言や、組織が旧宮野医院の科学者たちを引き抜いた歴史がその裏付けとなる。
烏丸蓮耶が半世紀以上前に表舞台から姿を消した時期と、組織が生命科学研究を本格化させた時期は奇妙なほど一致する。彼が求めたのは、単なる長寿なのか、あるいは自らの若返りと永続的な支配権の確立なのか。薬物の真の効能が解き明かされるとき、組織の存在理由そのものが暴かれることになる。