洛南高校は現在、生徒の学力特性や志望進路に合わせて「空（くう）パラダイム」と「海（うみ）パラダイム」の2つのコース制を採用しています。
【空パラダイムの進学先】
最難関国公立大学（東大・京大・旧帝大）および国公立大学医学部を目指す特進選抜コースです。内進生・高入生ともに学力最上位層が集まり、授業スピードや課題の難易度は極めて高く設定されています。合格実績の看板となる難関実績の大部分はこの空パラダイムから輩出されます。
【海パラダイムの進学先】
難関国公立大学や難関私立大学（早慶・関関同立など）を目指すコースです。部活動と学業をハイレベルで両立させる生徒も多く、大阪公立大学、同志社大学、立命館大学などの合格ボリュームゾーンを形成しています。
【指定校推薦枠の扱いと利用実態】
洛南高校には、慶應義塾大学、早稲田大学、上智大学、東京理科大学、同志社大学、関西学院大学など、主要難関私立大学からの豊富な指定校推薦枠が存在します。しかし、同校の生徒の多くは国公立大学志向が極めて強く、「最後まで国公立一般入試に挑戦する」というカルチャーが根強いため、早慶などの枠であっても余ることが珍しくありません。海パラダイムの一部の生徒や私立専願に切り替えた生徒にとっては、手厚い進路選択のセーフティネットとして機能しています。
