丸山ワクチン（SSM）が標榜する作用原理は、現代でいう「がん免疫療法」の先駆的アプローチに極めて近い。直接がん細胞を死滅させる従来の細胞障害性抗がん剤とは異なり、患者自身の生体防御機構を活性化させる生物学的応答調節物質（BRM）としての働きを主眼に置いている。
主成分である多糖体は、体内のマクロファージや樹状細胞、T細胞を刺激し、インターフェロンなどのサイトカイン産生を促すとされる。さらに特徴的なのは、がん病巣の周囲に膠原線維（コラーゲン）の増生を促し、腫瘍を強固に包囲して増殖や転移を物理的に封じ込めるという「被包化」理論である。つまり、がんを完全に消し去るのではなく、宿主の体内で「おとなしく共存させる」という思想だ。
だが、エビデンス（科学的根拠）を重視する現代の腫瘍内科学の視点は厳しい。国際的な医学文献データベースであるPubMedを検索しても、SSMに関する論文は基礎研究や限定的な症例報告、小規模な後方視的観察研究が中心であり、現代のゴールドスタンダードである大規模なランダム化比較試験（RCT）による延命効果の証明は乏しい。腫瘍の縮小率をもって有効性を測る従来の評価軸において、明確な統計的優位性を示せなかった点が、現代医学の主流派から懐疑的な目を向けられ続ける要因となっている。
