建築や家具の素材として日本人に古くから親しまれてきた両木材ですが、素材としての物理特性や経済価値には大きな開きがあります。
木目と色合いの観点では、スギは芯に近い赤身（心材）と外側の白太（辺材）の色のコントラストが鮮明で、力強く素朴な木目が現れます。対してヒノキは全体が淡いピンクから上品な黄白色を帯びており、きめ細やかで美しい光沢と均一な質感が際立ちます。
耐久性と強度の面では、ヒノキが圧倒的な優位性を持ちます。世界最古の木造建築である法隆寺の構造材として1300年以上耐え抜いてきた歴史が証明するように、ヒノキは伐採後200年ほどかけて強度が上昇し、耐水性や防虫性にも極めて優れています。一方のスギは組織内に空気を多く含むため、軽量で加工しやすい反面、ヒノキに比べると柔らかく、表面に傷や凹みがつきやすい性質を持っています。
市場価格においては、成長スピードが早く全国で広く植林されたスギは流通量が豊富で、比較的リーズナブルな価格帯で手に入ります。対してヒノキは成長に年月を要し、歩留まりの管理も厳格なため、高級木材としての高価格帯を維持しています。
