既存の味にひと工夫加えることで、さらなる満足感を引き出す高菜明太マヨ牛丼のアレンジ裏技もファンコミュニティで広く共有されています。
その筆頭が高菜明太マヨ牛丼のチーズトッピング（とろ〜り3種のチーズ追加）です。ピリ辛の高菜と明太マヨに、とろけるミックスチーズが加わることで、ジャンクフードとしての完成度が極限まで高まります。高菜の塩気とチーズのミルキーさが驚くほどマッチし、濃厚派には外せない鉄板カスタムとなっています。
さらに、卓上の「紅生姜」を多めに投入して酸味と辛味のアクセントを強調する食べ方や、温玉（温泉卵）を追加して全体をよりまろやかな卵黄ソース仕立てにする味変も高い評価を得ています。
