『シン・エヴァンゲリオン劇場版』公開直後、インターネット上を席巻した最大の憶測が「真希波・マリのモデルは庵野秀明総監督の妻である漫画家・安野モヨコ氏ではないか」という説でした。
主人公・シンジを過酷な箱庭から連れ出し、精神的な救済をもたらしたポジションが、かつて重度の鬱病に苦しんでいた庵野監督を実生活で支え、立ち直らせた安野モヨコ氏の私生活と重なって見えたことが発端です。SNSや匿名掲示板では「私小説的な結末」「身内びいきのキャラクター配置」などと早合点した言説が瞬く間に拡散しました。
しかし、この噂は公式によって完全に否定されています。
スタジオカラー公式Twitter（現X）および公式出版物において、制作陣は異例の明言を行いました。「マリのキャラクターデザインや演出、性格付けに安野モヨコ氏の影響は一切存在しない」と明確に釘を刺したのです。
実際の制作現場において、マリという存在を主に形作ったのは庵野秀明総監督本人ではなく、鶴巻和哉監督をはじめとする首脳スタッフ陣でした。庵野監督自身が「自分自身の内省から生み出すと、どうしても従来の暗いエヴァの枠組みに回収されてしまう」と危機感を抱き、あえて自身の手から離して鶴巻監督らにキャラクター構築を委ねたという証言が残されています。
声優を務めた坂本真綾氏に対しても、庵野監督からの直接的な細かい指示は少なく、鶴巻監督らとの対話を通じて「どこか浮世離れしていて、既存のキャラクターたちと異なるベクトルで生きている軽やかさ」が練り上げられました。「安野モヨコ投影説」は、作品の文脈と製作者のプライベートを安易に混同した、典型的なファンの過剰解釈に過ぎません。
