市販の醤油麹も手軽ですが、乾燥米麹と醤油さえあれば家庭で安価に大量の醤油麹を作ることができます。温度管理が難しい常温発酵（完成まで1〜2週間要し、毎日の攪拌が必要）に比べ、ヨーグルトメーカーを使った醤油麹の作り方は、温度ムラや過発酵の失敗がありません。
作り方の手順は以下の通りです。乾燥米麹200gをボウルで手早くほぐし、清潔なヨーグルトメーカー専用容器に入れます。そこへ濃口醤油300ml（または麹がひたひたに浸かる量）を注ぎ、スプーンで全体を均一に混ぜ合わせます。設定温度を58℃〜60℃、タイマーを6時間にセットしてスタートするだけで、その日のうちに芳醇な自家製醤油麹が仕上がります。
自家製調味料を長く安全に楽しむためには、醤油麹の賞味期限と保存容器の衛生管理が極めて重要です。出来上がった醤油麹は粗熱を取り、必ず熱湯消毒またはアルコール消毒を施したガラス製やホーロー製の密閉保存容器に移し替えてください。プラスチック容器は長期間の使用で匂い移りや色移りが発生しやすいため、密閉性の高いガラス瓶が推奨されます。
保存は必ず冷蔵庫（10℃以下）で行い、賞味期限の目安は約3ヶ月です。使うたびに清潔で乾いたスプーンを使用し、雑菌の混入を防ぐ配慮を心がけてください。小分けにして冷凍保存（約半年間保持可能）することもでき、塩分濃度の関係で完全には凍結しないため、使いたい分だけスプーンですくって即座に調理可能です。
