どのような優れたバイオ医薬品にもリスクは伴います。受診前に正確に把握しておくべきゾレア花粉症副作用の筆頭は、注射部位反応です。皮下注射を行った腕やお腹の皮膚に、赤み（紅斑）、腫れ、痛み、かゆみが生じる頻度が数％から十数％報告されていますが、そのほとんどは投与後数日以内に自然軽快します。また、軽度の頭痛や全身の倦怠感を覚える患者も一定数存在します。
医療者が最も警戒するのは、極めて稀ながら発現する可能性のある「アナフィラキシーショック（急性全身性アレルギー反応）」です。発症率は0.1〜0.2％程度と低頻度ですが、呼吸困難、血圧低下、全身の激しい蕁麻疹、意識混濁などを引き起こす危険があります。
このため、日本アレルギー学会および添付文書のガイドラインに従い、アレルギークリニックや耳鼻咽喉科では初回投与後および用量変更後の約30分間は院内で待機し、急変が起きないかを観察する厳重な安全プロトコルが敷かれています。帰宅後も激しい運動や長風呂、多量の飲酒は避け、万が一体調に異変を感じた際のエマージェンシー体制が整っている医療機関で受診することが鉄則です。
