利尻島への海路を一手に担うハートランドフェリーは、稚内港を起点に利尻島および隣の礼文島を結ぶ重要インフラです。稚内港から利尻島へのフェリー所要時間は片道約1時間40分〜1時間50分で運航されています。
運航ダイヤ（時刻表）は季節によって大きく変動する「季節ダイヤ」が採用されています。観光の最盛期となる夏季（6月〜8月）には1日3〜4便程度運航されますが、冬期（11月〜翌3月頃）は海上の荒天や需要減少に伴い1日2便前後まで減便されます。また、就航船には「ボレアース宗谷」やバリアフリー設備が充実した「アマポーラ宗谷」などが充当され、船内での快適なクルージングが確保されています。
利尻島と礼文島（香深港）を結ぶ直行ルートも運航されており、こちらの所要時間は約40分〜45分です。利尻・礼文の2島周遊を計画する場合、稚内へ戻らずに直接島間を移動できるため、移動時間を大幅に圧縮できます。ただし、島間連絡便は便数が限られているため、綿密な時刻表の照合が不可欠です。
