図鑑埋めの最大の障壁となるのが、通常フィールドでは遭遇できない特殊な妖怪ウォッチ4 妖怪 入手方法の存在です。これらは大きく分けて「ガシャ限定」「サブクエスト報酬」「レジェンド解放」の3つのカテゴリに分類されます。
まず「妖怪ウォッチ4 ガシャ限定妖怪」については、各世界に設置された妖怪ガシャから排出される「専用コイン(5つ星コイン、ワンチャンコイン、極コインなど)」を消費して狙う必要があります。ガシャの中身は日替わりでテーブルが変動するため、目当ての妖怪がラインナップされている日に高級コインを集中投入するのがセオリーです。
次に「妖怪ウォッチ4 クエスト限定 妖怪」は、本編クリア後に各地で発生する「うすらぬらクエスト」や特定キャラクターの専用ミッションを完了することで加入します。例えば、カイラや酒呑童子、洞潔といった人気キャラクターは、それぞれの因縁を描いた重厚なストーリークエストを攻略することが正式加入の絶対条件となっています。
そして、シリーズ伝統の「妖怪ウォッチ4 レジェンド妖怪 解放条件」は、指定された特定の妖怪たちを集める、あるいは特定アイテムを揃えて魂カツマッチングを成立させることで達成されます。ブシニャンやしゅらコマ、山吹鬼といった屈指の強豪たちは、各地の探索とクエスト攻略の集大成として仲間に加わる仕様です。