コーカソイドとモンゴロイドを視覚的に隔てる最大の要因は、頭蓋骨の構造と顔面の立体感にあります。正面から見た際、モンゴロイドの骨格特徴としてまず挙げられるのが、横に張り出した頬骨と平坦な顔郭です。鼻根部が低く、目元には「蒙古襞（もうこひだ／内眼角贅皮）」と呼ばれる皮膚の被さりが発達しているため、一重まぶたやすっきりとした切れ長の目元になりやすい傾向があります。
一方、コーカソイドの顔立ちは前後に奥行きが深い三次元的な立体構造を誇ります。眉間から鼻梁にかけての骨（鼻骨）が前方に鋭く突出し、眼窩（目の入る窪み）が深く刻まれているため、目と眉の距離が極めて近く、陰影の強い彫りの深い顔貌が形成されます。また、前歯の裏側にも明確な骨格差が存在し、モンゴロイドの多くに見られる「シャベル状切歯（スプーンのように窪んだ前歯）」は、コーカソイドにはほとんど見られません。
全身のアジア人とヨーロッパ人の骨格差を見ても、プロポーションに明確な傾向が存在します。コーカソイドは骨盤が前傾しやすく、下肢（特に膝下）が長い傾向にあります。対してモンゴロイドは胴長で重心が低く、骨盤が後傾気味で筋肉の付着部が幅広く発達しています。これらは後述する生息環境への適応プロセスによって長い年月をかけて獲得された形態差です。
