公道では、上記4色以外の極めて特殊なカラーリングや形状を持つナンバープレートに遭遇することがあります。これらはいずれも特別な法的資格や一時的な公道走行を認める行政処分に基づいています。
1. 青ナンバー（外交官用車両）
青ナンバー外交官プレート（外務省発行）は、青地に白文字で「外-〇〇〇〇」や「領-〇〇〇〇」「代-〇〇〇〇」と記載されます。ウィーン条約に基づく「外交特権」が認められており、日本国内の法執行において治外法権的な扱いを受ける場合がありますが、放置駐車などの交通違反に対しては外務省を通じて厳格な反則金納付要請が行われています。
2. 赤い斜線／赤枠（仮ナンバー・臨時運行許可）
白地に赤い斜線が引かれたナンバープレート赤斜線仮ナンバー（道路運送車両法第34条に基づく臨時運行許可番号標）は、車検切れの車両を車検場まで回送する場合など、極めて限定的なルート・期間（最長5日間程度）に限り市区町村から貸与されます。また、赤い枠線で囲まれたプレート（回送運行許可番号標・通称「ディーラーナンバー」）は、自動車メーカーや販売業者が仕入れ・販売に伴う回送を行うために保有する業務専用標識です。
3. 自衛隊車両ナンバープレート
自衛隊のジープや大型トラックには、一般的な地名表記やひらがなが一切なく、「01-2345」のような6桁の数字のみが白地に黒文字で記載された自衛隊車両ナンバープレートが装着されています。これは自衛隊法第114条により道路運送車両法の規定が適用除外とされているためで、防衛大臣直轄の車両管理規定によって運用されています。
4. 駐留米軍車両（Yナンバーなど）
プレートの色自体は白や黄色ですが、ひらがな部分に「Y」「E」「A」などのアルファベットが刻印されている車両は、日米地位協定に基づき在日米軍関係者が私用・公用で使用する車両です。なお、近年増えている希望ナンバーの分類番号におけるアルファベット入りナンバープレート（例：品川500 Aなど）とは制度上の目的が異なります。
