福岡県立スポーツ科学情報センターは、豊かな自然に囲まれた東平尾公園エリアの一角に位置しています。最寄りの主要交通結節点は福岡空港や地下鉄空港線の東比恵駅、JR博多駅です。
公共交通機関を利用する場合、博多バスターミナルや福岡空港から運行されている西鉄バスを利用し、「アクシオン福岡前」または「東平尾公園入口」バス停で下車するのが最も確実です。
自家用車で来館する場合、施設利用者向けの専用駐車場（約数百台収容）が完備されています。ただし、隣接するベスト電器スタジアム（東平尾公園博多の森球技場）などでJリーグの公式戦や大規模イベントが開催される日には、周辺道路および駐車場が極めて激しく混雑します。週末に来館する際は、事前に東平尾公園全体のイベントスケジュールを確認しておくことが推奨されます。
