指定自動車教習所を無事卒業しても、それですぐに免許が交付されるわけではありません。卒業証明書を持参し、橿原市新ノ口にある奈良県運転免許センター（新ノ口駅徒歩約10分）で最終関門である「本免許学科試験」に合格する必要があります。
奈良県の本免学科試験は、基礎的な交通ルールの理解はもちろん、複雑な交差点の優先関係や標識・標示の引っかけ問題が緻密に出題されることで知られています。教習所によっては、校内で本免試験を模した「効果測定」の模擬試験をオンラインで何度も受験できるシステムを用意しており、本番での一発合格率を高める手厚いバックアップを行っています。
また、免許取得後にしばらく運転機会がなく不安を抱える市民向けに、県内各校が提供しているペーパードライバー講習も需要が高まっています。ならやま大通りや国道24号線、阪奈道路など、奈良特有の交通量が多い幹線道路や狭小路での車庫入れを重点的に練習できる実践的なカリキュラムが用意されており、再教育の場としても教習所は重要な役割を果たしています。
