結論から言うと、草間彌生美術館ではチケットなしでの入館およびショップのみの利用はできません。ミュージアムショップは美術館のエントランスを入った1階フロアに位置していますが、受付および入場チェックを経た鑑賞エリア内に組み込まれています。
一般的な大型美術館ではショップのみ路面店感覚で立ち寄れるケースもありますが、草間彌生美術館は完全日時指定の事前予約制を採用しており、建物の構造上もフリー入店ができない仕組みになっています。「近くを通りかかったからグッズだけ買いたい」と立ち寄っても入場を断られてしまうため、必ず事前に公式サイトからチケットを購入して入場する必要があります。