ジ・エンドに降り立った瞬間、プレイヤーが最初に対処すべきは、空を舞うドラゴン本人ではなく、周囲にそびえ立つ黒曜石の柱の上に設置された「エンドクリスタル」です。このクリスタルはエンダードラゴンの体力を毎秒一定レートで急速自動回復させ続けるビームを放つため、全クリスタルを破壊しない限り、本体へのいかなる攻撃も徒労に終わります。
ここで初心者がつまずきやすいのが、エンドクリスタル 破壊のコツです。10本ある黒曜石の柱のうち、2本にはクリスタルを囲うように「鉄格子」のケージが配置されています。剥き出しのクリスタルは地上から弓矢や雪玉を正確に撃ち込めば容易に爆破できますが、鉄格子のクリスタルは矢が弾かれてしまうため、直接柱をブロックや水流で登り、格子をツルハシで壊して叩く必要があります。破壊時には大爆発を引き起こすため、ブロック越しに叩くか、格子を壊した瞬間に後退して矢を放つなど、爆風ダメージを直接受けない距離感を保つ配慮が不可欠です。
また、対空戦において「矢を放っているのにダメージが通らない」と焦るプレイヤーが後を絶ちません。このエンダードラゴン 弓 当たらない 理由には、ゲーム内の仕様に基づく明確な物理トリガーが存在します。
第一に、エンダードラゴンが中央の岩盤ポータル上空へ降りてくる「止まり木フェーズ（Perching）」に入っている間、本体は矢や雪玉などの投擲物に対して完全な無敵バリア判定を持ちます。飛来した矢はカキーンと甲高い音を立てて弾き返されるため、このフェーズでは弓矢の乱射は矢の無駄遣いとなります。第二に、ドラゴンの当たり判定（ヒットボックス）は巨大な翼ではなく、胴体と頭部に集中しています。旋回飛行中の翼の先端をいくら射貫いてもダメージ判定は発生しません。遠距離射撃を行う際は、旋回軌道を先読みして「頭部正面」を捉えるエイムが求められます。
